Uz Muhameda Šišića, Trećestepeno vijeće Suda BiH je u aprilu 2019. osudilo Tarika Šišića i Aziza Šušu na po osam godina zatvora za zločin počinjen u augustu 1992. na području sela Kukavice.
Oni su prethodno oslobođeni u prvostepenom postupku, a osuđeni u drugostepenom nakon žalbi.
Muhamed Šišić je, prema presudi, bio komandir Diverzantskog voda Kukavičke čete Armije BiH, a druga dvojica optuženih pripadnici ove jedinice. S njima je bio optužen i Emir Drakovac, koji je pravosnažno osuđen na jedinstvenu kaznu zatvora od 15 godina. Oni su osuđeni za napad na kolonu srpskih izbjeglica koje su 27. augusta 1992. godine krenule iz mjesta Jabuka kod Goražda prema Rogatici.
Muhamed Šišić je u junu 2019. godine podnio apelaciju Ustavnom sudu smatrajući da mu je povrijeđeno pravo na pravično suđenje, kao i pravo na poštovanje privatnog i porodičnog života, te kršenje zabrane diskriminacije, ali je Sud 2021. godine tu apelaciju odbio kao neosnovanu.
Šišić je danas ukopan u Sarajevu, a u smrtovnici se navodi da je nosilac priznanja “Zlatni ljiljan”.
